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孤岛危机3-全剧情流程攻略—故事版
超人类
收起超人类丛林召唤罪恶之源险象环生红星升起人的力量众神与魔鬼总评
第一关：超人类POST HUMAN
地点：纽约自由穹顶西面第30号门(West 30th Gate,Liberty Dome,NY)
时间：2047年11月29日凌晨4点30分(04:30,November 29th, 2047)
茫茫雨夜，塞可(Psycho)带着几名部下登上了CELL的货船，用消音武器清除了几名敌兵后找到了关押普若非(Prophet)的货柜，重新启动以后塞可的部下走进货柜，突然苏醒的普若非抓住了此人，塞可解释之后普若非放下了他，问他的纳米服到哪去了，塞可回答说除了普若非，CELL脱掉了其他人的纳米服，随后塞可给了普若非一把HammerⅡ手枪，这把手枪有不同的弹种，还能加装激光瞄准器。
塞可让两个部下去吸引敌人，告诉普若非想要把他送进穹顶内部，但敌人已经不是早期的Alpha-Ceph，塞可提到普若非先前在西伯利亚被CELL用k-volts枪击倒，封在柜子里很多年，这些人脱掉了其他人的纳米服，并准备以同样手段脱掉普若非的。
进入室内后给手枪加上消音器，击倒一名士兵后就能拿到Feline，经过下面的仓库来到对面的房间里打开大门，塞可进入后穿过过道，在另一边的玻璃窗前塞可交给普若非一把复合弓，便于其隐身暗杀，但普若非刚开始并不喜欢这把弓。塞可解释说谈激光枪能够把弓投射到纳米服上，弓的动能足够干掉犀牛，而且还带有爆炸箭头，最重要的是使用弓箭时仍然能够保持隐身。
这时队友汇报已经突破四号大门，穹顶东墙边的风速超过运行上限，清除下层区域的敌人后登上旁边的楼梯，走出大门后外面的货船上发生了爆炸，在过道末尾使用纳米服远程控制窗户里的计算机打开大门，里面是CELL总部，大约有一两千的特种兵，在楼下的显示器前塞可发现了剥掉他纳米服的CELL士兵，在剥掉纳米服时很多人因心脏无法承受，在惨叫中痛苦的死去。外面雨中的过道上有不少CELL士兵，有些人装备了Scar。
通过以后用纳米服打开大门，和塞可分头行动，普若非问他行不行，塞可还调侃说他才不需要纳米服。走廊边上的箱子里可以拿到K-volt电枪，出去以后是仓库区，打开另一面的大门后控制对面的机枪塔，这个装置会帮助普若非控制住那条走廊，打开右侧的大门后不久和塞可会合，塞可说他们将和他的部下会合，普若非好奇的问他说你现在居然有部下了?塞可说他一向有部下。
普若非利用纳米服的功能查看了塞可的资料，他的变节率(renegade)是87.3%，行为不和常规率(maverick)是74%，违抗命令(disobedient)的可能性是58.6%，失去控制(out of control)的可能性是45.1%，播放的一段 是孤岛危机一代第一关末尾发现那艘冰冻的轮船后，塞可公然违抗普若非命令的场面。
在电梯中，塞可说大多数人都是债务的奴隶，CELL控制了所有能源，普通人无法支付账单，只能通过不停工作来偿还，当然还有另一种选择就是进行反抗。电梯停止后他们进入一个房间，塞可打开了窗口的护罩，迷蒙的阳光下，纽约市的废墟一览无遗，纳米服竟然收到了城市中传来的能源信号。
原来CELL利用Ceph的科技在穹顶中建造了一台机器，通过这台机器向全球供电。塞可认为只能破坏CELL的能源，就能除掉CELL。异形已经是过去时，只不过残留了一些残兵败将，但CELL正在逐步控制整个世界，普若非应该帮助他们除掉CELL。
但是普若非认为Alpha-Ceph曾经给过他一个预示(vision)，人类曾经在过去经历过这些事情，两者之间必有联系，事情并不简单，需要寻找线索跟进，这不仅仅是场简单的革命。
CELL并不知道他们正在做的事情将会导致世界毁灭，因此必须阻止CELL的进一步行动。
《孤岛危机3》第三关图文流程攻略
3：THEROOTOFQLLEVIL
收集要素：
数据版(DATAPADS)X4
宣传海报(PROPAGANDAPOSTERS)X1
黑盒(BLACKBOX)X3
剧情攻略：
地点：纽约金融区拿索街(NassauStreet,FinancialDistrict,NY)
时间：2047年11月29日下午13点45分(13:45,November29th,2047)
只要CELL控制着能源，就控制和奴役着人类，CELL的查克曼(zuckermann)能源枢纽被称为X系统，位于百老汇车站地下几百米处的收割厂中，这里守卫严密，是CELL的阿喀琉斯之踵，即主要弱点。抵抗组织在过去几个月蒙受了重大损失，因此克莱尔不得不担起重任，宁可玉碎不为瓦全。
任务流程：
跟随来到Psycho指挥中心，遇见指挥官Claire与纳米装甲设计者Rasch。
1.前往摧毁CELL的能量源SystemX。前往大坝关闭2做发电机切断动力。选择右侧道路，黑入炮塔后配合消灭敌人。
2.来到大坝上，小心敌人会投掷手雷。分别进入2座发电机内，破坏电源。
3.随后工具提示来到大坝下方，安装C4引发爆炸。
4.顺着水流不断向前，途中会遭遇一小波侦察兵。
5.来到SystemX所在基地，消灭门口守卫X2，进入大门也可以关闭门外地雷阵通过管道潜入。基地内敌人不多，可以轻松解决。乘坐电梯向下，重启2处开关获取控制设备控制权。
6.随后会出现机枪炮塔，隐形时可以躲避攻击，可以选择黑入设备破坏(难度较高，传输波较多)或者直接隐形强行闯入电梯内。
7.来到最上层控制中心，开门后消灭雇佣兵X4，关闭设备失败，爆炸后被冲击波震飞到远处。
先利用狙击消灭高处敌人，随后的战斗会方便很多
隐形时选择合理的方向攻击敌人
潜入射击游戏正面对战并不是游戏的精髓，潜行杀戮的快感才是真理
手速过慢的同学可以选择隐形后，硬闯过机枪塔。